Kapselung
FCoE kapselt genau einen FC-Frame und eine geringe Prüfsumme in einen Ethernet-Frame, das heißt, FC-Frames werden nicht auf mehrere Ethernet-Frames fragmentiert. Auch mehrere kleinere FC-Frames werden nicht in einen Ethernet-Frame konsolidiert. Damit sind FCoE-Frames native Layer-2-Ethernet-Frames mit der charakteristischen Ethertype-Kennung "FCoE".
Im Gegensatz zu iSCSI, das native SCSI-Daten über TCP transportiert, wird bei FCoE dieser Protokoll-Overhead dadurch vermieden, dass die Daten ohne die Daten der höheren Protokollschichten übermittelt werden.